填料除了對生物進化系統的凈化效果造成影響之外，會對整個生物處理系統的經濟性與穩定性產生影響。

具體表現為，能夠對微生物的附著性、填料床的透氣性、含水率、營養供給、使用時問、更換頻率等方面造成影響。

在常見的填料中，主要分為兩大類，即有機填料與無機填料。有機填料主要包木屑、玉米芯、高分子鮑爾環等。無機填料主要包含陶粒、活性炭、沸石等。

無機填料具有比較大的密度，不能為微生物供給營養物質，需要定期對有關營養物質進行補充。

有機填料機械強度比較低，較易產生床體壓實情況，進而生成比較大的壓降。

微生物生長比較適宜的溫度為25～35℃。倘若溫度過低，其會處于休眠狀態，廢氣治理效果比較差；倘若溫度高于比較高生長溫度，則不再生長，甚至死亡，同樣廢氣治理效果差強人意。溫度還會對污染物的物理狀態造成影響，進而對廢氣凈化效果產生影響。

在設備入口位置處，可以對溫度感應器進行安裝，一旦溫度過低，可以通過加熱器對循環水進行加熱工作，進而確保進入生物治理裝置的廢氣溫度能夠滿足相關要求與規定。

在微生物的生長中，濕度也具有重要的影響作用。倘若濕度過高，就會增加氣體通過濾床的壓降，減少其停留時間，產生供氧不足的情況，進而降低降解速率。

倘若濕度過低，微生物就會出現死亡情況。微生物比較適宜的生長濕度為40%至60%。在生物治理裝置中，其靠前段應當設計成噴淋水洗段，在其后兩級生物處理段應當設計成間歇式噴淋，進而使廢氣濕度能夠符合有關要求與規定。